Năm 2025, Nhà trường thực hiện Tự đánh giá hướng tới Kiểm định chất lượng 05 CTĐT trình độ thạc sĩ. Để triển khai các hoạt động, Nhà trường thành lập 05 Hội đồng tự đánh giá các CTĐT theo các Quyết định số 1571-1575/QĐ-ĐHCNGTVT ngày 12/3/2025 và xây dựng các kế hoạch tự đánh giá số 1787-1791/KH-ĐHCNGTVT ngày 14/3/2025
| STT | Tên ngành | Mã ngành | Quyết định thành lập Hội đồng | Kế hoạch Tự đánh giá | Ghi chú |
| 1 | Kỹ thuật cơ khí động lực | 8520116 | Số 1571/QĐ-ĐHCNGTVT ngày 12/3/2025 | Số 1787/KH-ĐHCNGTVT ngày 14/3/2025 | |
| 2 | Kỹ thuật xây dựng công trình giao thông | 8580205 | Số 1572/QĐ-ĐHCNGTVT ngày 12/3/2025 | Số 1788/KH-ĐHCNGTVT ngày 14/3/2025 | |
| 3 | Quản trị kinh doanh | 8340101 | Số 1573/QĐ-ĐHCNGTVT ngày 12/3/2025 | Số 1789/KH-ĐHCNGTVT ngày 14/3/2025 | |
| 4 | Quản lý kinh tế | 8310110 | Số 1574/QĐ-ĐHCNGTVT ngày 12/3/2025 | Số 1790/KH-ĐHCNGTVT ngày 14/3/2025 | |
| 5 | Tổ chức và quản lý vận tải | 8840103 | Số 1575/QĐ-ĐHCNGTVT ngày 12/3/2025 | Số 1791/KH-ĐHCNGTVT ngày 14/3/2025 |
